En la llamada Guerra Gaucha no sólo defendió la independencia de las Provincias Unidas declarada en el Congreso de Tucumán, sino que también contuvo y rechazó el avance español desde mediados de 1816 hasta 1821, además de formar parte del plan continental del general San Martín. Fue muy importante su figura en la guerra de Independencia, y sirvió de apoyo en las luchas de Manuel Belgrano y la gesta emancipadora de San Martín. El 17 de junio de 1821 Martín Miguel de Güemes falleció a los 36 años de edad, tras agonizar durante diez días luego de ser alcanzado por una bala realista, lo que lo convirtió en el único general muerto en combate.
 

Sus restos descansan en el Panteón de las Glorias del Norte, ubicado en la Catedral Basílica de Salta, pero sus ideales de libertad, su amor a la patria, su valentía, su ingenio y su tenacidad son el motor que impulsa a quienes lo llevan en su corazón y le rinden emocionado homenaje al recordarlo.